殺菌鍋從控制方式上分有5種，分為手動控制型、電氣自控型、電腦自控型、電腦半自動控制型、電腦全自動控制型（遠程控制型）等。

從殺菌方式上分為3種：水浴式殺菌、蒸汽式殺菌、噴淋式殺菌。

從罐體結構上分有7種：單罐殺菌鍋、雙層殺菌鍋、雙鍋并聯式殺菌鍋、三鍋并聯式殺菌鍋、立式殺菌鍋、電汽兩用殺菌鍋、旋轉式殺菌鍋。